Tim SAR gabungan berhasil menemukan dan membawa kotak hitam dan Emergency Locator Transmitter (ELT) milik pesawat Smart Air dari lokasi kejadian ke kota Tarakan pada Senin (11/3). Kedua kotak tersebut kemudian diserahkan kepada Komite Nasional Keselamatan Transportasi (KNKT) untuk dilakukan investigasi terkait penyebab jatuhnya pesawat Smart Air.