Justin Hubner memulai petualangan sepakbolanya di akademi FC Den Bosch sebelum direkrut oleh Wolverhampton Wanderers pada Februari 2020. Di Wolves, dia awalnya bergabung dengan tim U-18 dan U-21 sebelum kemudian menandatangani kontrak baru selama 2,5 tahun pada Februari 2023. Meskipun belum menjadi pemain reguler, Justin Hubner telah merasakan atmosfer Premier League dan bahkan masuk dalam skuad sebagai pemain cadangan dalam beberapa pertandingan.
Pada tahun 2024, Hubner mendapatkan kesempatan berharga untuk dipinjamkan ke Cerezo Osaka di J1 League Jepang guna menambah pengalaman. Namun, masa peminjamannya di Jepang berakhir lebih cepat dari yang diharapkan setelah beberapa penampilan.
Dengan pengalaman bermain di berbagai kompetisi seperti Premier League U-18, Premier League 2, FA Youth Cup, dan EFL Trophy, Hubner telah tumbuh menjadi pemain yang tangguh dan berpengalaman. Sebelumnya dikaitkan dengan Timnas Indonesia pada Oktober 2022, potensi besar Hubner telah menarik perhatian sejak lama sebelum dia menjadi WNI.