Ketua Umum Partai Kebangkitan Bangsa Muhaimin Iskandar menjelaskan alasan ketidakhadiran Menteri Pertahanan sekaligus Presiden Terpilih Prabowo Subianto pada Muktamar PKB 2024. Menurutnya, Prabowo tidak hadir karena kondisinya sedang kurang sehat dan mengalami masuk angin. Sebelumnya, Wakil Ketua Umum PKB Jazilul Fawaid juga memahami ketidakhadiran Prabowo dan menyatakan bahwa yang terpenting adalah PKB tetap ada di hati Prabowo.
Meskipun demikian, Prabowo berkomitmen untuk menghadiri Muktamar VI PKB namun agenda mendesak membuatnya batal hadir. Sebelumnya, Prabowo hadir di penutupan Kongres Ke-6 Partai Amanat Nasional (PAN) di Jakarta. Muktamar VI PKB sendiri diadakan di Bali dengan jumlah peserta mencapai 2.888 orang.
Meskipun Prabowo tidak hadir, PKB tetap berkomitmen untuk menyukseskan pemerintahan Prabowo dan akan memberikan masukan serta solusi untuk mendukung pemerintahan. Selain itu, PKB juga mengakui bahwa Prabowo memiliki agenda lain yang lebih mendesak sehingga tidak bisa hadir di Muktamar PKB.