Babak kedua dimulai. Indonesia berhasil menyamakan kedudukan 1-1 meski hanya melepas satu tendangan ke gawang Bahrain.
Pelatih Shin Tae-yong melakukan pergantian pemain dengan memasukkan Eliano Reijnders dan Rizky Ridho untuk menggantikan Sandy Walsh dan Jordi Amat.
Pemain Bahrain, Kamil Al-Aswad, terjatuh setelah berbenturan dengan Calvin Verdonk, namun tidak ada hukuman yang diberikan. Meskipun Bahrain memprotes, VAR tidak merespon permintaan mereka.
Di menit ke-58, Indonesia melakukan pergantian personel ketiga dengan memasukkan Marselino Ferdinan untuk menggantikan Malik Risaldi dengan harapan dapat menambah daya serang tim.
Bahrain juga merespon dengan melakukan tiga pergantian pemain untuk menyegarkan tim, namun tempo permainan tetap lambat.
Di akhir pertandingan, Bahrain akhirnya berhasil menyamakan kedudukan menjadi 1-1 melalui gol Mohamed Marhoon di menit ke-90+9 setelah tekanan yang berkelanjutan.
